Usługa sukcesywnego sekwencjonowania pulowanych bibliotek genomowych metodą nowej generacji NGS (Next Generation Sequencing) na platformie Illumina

1. Przedmiotem zamówienia jest usługa sukcesywnego sekwencjonowania pulowanych bibliotek genomowych metodą nowej generacji NGS (Next Generation Sequencing) na platformie Illumina – ramach projektu LIDER XII: „Opracowanie narzędzia diagnostycznego z wykorzystaniem techniki wysokoprzepustowego sekwencjonowania nowej generacji do kompleksowej diagnostyki molekularnej wybranych fakomatoz ze szczególnym uwzględnieniem neurofibromatozy typu I” finansowanym ze środków Narodowego Centrum Badań i Rozwoju (NCBiR), nr umowy grantowej LIDER/45/0234/L-12/20/NCBR/2021.2. Usługa składa się z trzech integralnych części:- oceny jakości dostarczonych bibliotek, - pulowania ekwimolarnego oraz - sekwencjonowania.3. W celu zachowania ciągłości metodyki oraz porównywalności uzyskanych wyników badań w analizie bioinformatycznej z danymi wynikowymi z poprzednich analiz NGS, sekwencjonowanie przeprowadzone zostanie na platformie Illuminy.4. Zamawiający dopuszcza platformę równoważną tj. (platforma równoważna z wykorzystaniem metodologii sekwencjonowania przez syntezę (ang. Sequencing by synthesis, SBS), która powinna zapewnić zachowanie ciągłości wyników badań i ich porównywalność w analizie bioinformatycznej z danymi wynikowymi z poprzednich analiz NGS, z której Zamawiający korzystał dotychczas tj.: z platformy: Illumina NovaSeq X).5. Oferowany produkt równoważny powinien:a) wykorzystywać metodologię sekwencjonowania przez syntezę (ang. Sequencing by synthesis, SBS).b) zapewnić zachowanie ciągłości wyników badań i ich porównywalności w analizie bioinformatycznej z danymi wynikowymi z poprzednich analiz NGS.6. Wszelkie zapisy zawarte w specyfikacji warunków zamówienia wskazujące na typ, znaki towarowe lub pochodzenie przedmiotu zamówienia należy odczytywać wraz z wyrazami „lub równoważne”. Nazwy własne są jedynie przykładowe, nie wskazują na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. Wykonawca, oferując przedmiot równoważny do opisanego w specyfikacji jest zobowiązany zachować równoważność w zakresie parametrów użytkowych, funkcjonalnych, gabarytowych i jakościowych oraz estetycznych, określonych przez Zamawiającego w specyfikacji, jako parametry równoważności, a w stosunku do części materiałów w zakresie estetyki, które muszą być na poziomie nie niższym od parametrów wskazanych przez Zamawiającego. Obowiązek udowodnienia, że oferowane wyroby są równoważne spoczywa na Wykonawcy. 7. Zakres zamówienia obejmuje, zamówienie podstawowe oraz zamówienie objęte opcją tj. zakres podstawowy oraz zakres opcjonalny – zgodnie z załącznikami nr 1.1 oraz załącznik nr 3 do SWZ. a) Zamawiający informuje, że zamówienie podstawowe jest to zamówienie, które zostanie zlecone Wykonawcy. Zamawiający zastrzega sobie prawo do niezrealizowania 50% wartości przedmiotu zamówienia podstawowego, bez konieczności zmiany warunków Umowy.b) Zamówienie objęte prawem opcji to zamówienie z którego Zamawiający skorzysta w zależności od kierunku badań i bieżących potrzeb Zamawiającego.c) Zamawiający zastrzega sobie prawo do nie zrealizowania zamówienia z prawa opcji w części lub w całości. Z tego tytułu Wykonawca nie będzie wysuwał w stosunku do Zamawiającego żadnych roszczeń. d) O skorzystaniu z prawa opcji Zamawiający każdorazowo będzie powiadamiał przedstawiciela Wykonawcy wskazanego w Umowie wysyłając e-mailem zamówienie.8. Szczegółowy opis przedmiotu, zakres i sposób realizacji został opisany w załączniku nr 3 do niniejszej Specyfikacji Warunków Zamówienia, zwanej dalej SWZ. 9. Szczegółowe postanowienia dotyczące wykonywania zobowiązań odnoszących się do niniejszego zamówienia zawarto w projekcie umowy – załącznik nr 4 do SWZ.